Pflanzenzellen mit 3D-Bildern analysieren

Mit einem neuen Bildverarbeitungsprogramm ist es möglich, Pflanzenzellen dreidimensional im Detail darzustellen und zu analysieren. An der Entwicklung der als Open-Source-Anwendung konzipierten Software PlantSeg haben Biowissenschaftler und Informatiker der Universität Heidelberg mitgewirkt. Sie basiert auf Methoden des maschinellen Lernens und kann eingesetzt werden, um den Prozess der Morphogenese - die Herausbildung der Gestalt von Pflanzen - auf zellulärer Ebene zu untersuchen. Dadurch erhoffen sich die Wissenschaftler ein besseres Verständnis entwicklungsbiologischer Prozesse wie zum Beispiel der Artenbildung. Die Forschungsergebnisse sind im Fachmagazin ,,eLife Sciences" erschienen. ,,Um untersuchen zu können, wie sich die Organe von Pflanzen, etwa Blätter, Blüten oder Wurzeln, herausbilden, müssen einzelne Zellen abgebildet und ihre Entwicklung über die Zeit dargestellt werden", erläutert Alexis Maizel vom Centre for Organismal Studies der Universität Heidelberg. Diese Analyse wurde bislang hauptsächlich zweidimensional durchgeführt, etwa durch Querschnitte.